ビザ申請は、法務省の裁量にて行われています。

不服申し立てなどが認められていませんので、極めて裁量が大きい手続です。

しかし、審査基準や審査要領は全国一律です。

入管の職員も、なるべく分け隔てなく審査しようと、日々努力しています。

これは推測ですが、日本の入管では、概ね平等に審査が行われているように考えています。
もちろん、人のすることですから、多少の審査結果に幅があります。入国管理局の方針によっても、審査の厳しさが変わることがあります。
人が行う法解釈ですから、やむを得ません。

前述のように、審査は概ね平等に行われています。

しかし、例えば、ある国からの入国者の多くで偽装結婚や不法就労が行われている場合などには、その国からの入国者の審査は慎重になります。

厳しくなるというより、違法を見逃すわけにはいきませんので、慎重な審査が行われるようになります。

違法行為を行っている者は、多くの仲間を勧誘しようとします。

金銭が絡んでいる場合は、多くの者を巻き込んだほうが利益が大きくなります。

そういった行為を、取り締まるためです。

そのため、国によって審査の慎重さは異なるケースがあります。

審査期間が長い国と短い国、追加資料をやたらと求められる国などは、やはりあります。